ゲノム解析アプリケーション　

研究者自らがBioinformaticianになれるゲノム解析ソフト

Socrates（ソクラテス）はGUI操作（プログラミングが不要でマウスのみで操作）にてゲノム解析が可能なソフトウェアです。

RNA-seq解析などで、あるサンプルを抜いて解析したい、発現変動遺伝⼦の推定でカットオフ値を変更して解析したい、などの場⾯はありませんか？

共同研究者や受託業者に意図が伝わらず、⻑い時間待ち、何度もやり直しをすることは、研究遂⾏に⼤きな障害になると思います。

Socratesはそんな悩みを解決するアプリケーションです。

研究者をBioinformaticianに変えてしまうソフトが「Socrates」です。

SocratesによるRNA-seq解析

①データフィルタリング；メタ情報を参考にして、サンプル条件を選択して、解析対象を選びます（例；薬剤投与A群とB群のみ）

②データの俯瞰：クラスタリングなどによってデータを俯瞰し、除外したいサンプルなどを選びます

③比較する条件を選んで、変動遺伝子の推定を⾏います

④変動遺伝子の推定を⾏います。FCやQ.valueなどのカットオフ値の変更も簡単にできます

⑤視覚的な把握のための作図も簡単にできます。Heatmap, Volcano plot、Gene enrichment解析の結果が美しいFigureとして作図可能です。条件をその場で変更すれば、対応したFigureが得られます

解析レポート

解析レポートはhtml形式で、リンクなどが埋め込まれているため、ファイルを探す手間なく、見やすい仕様になっています。

Socratesはマウス操作で、サンプルをフィルタリングしたり、様々な解析が可能です。